La préfecture a en charge six missions prioritaires à l'échelle du département :
Le Secrétariat général commun départemental :
Dans le cadre général de la réforme de l’organisation territoriale de l’État (OTE), ce service interministériel sous l'autorité du préfet, est chargé - pour la préfecture et les directions départementales interministérielles (DDI), du pilotage et de la gestion, des ressources humaines et de la formation, des compétences, des achats et finances, du dialogue social et de la prévention en matière de santé et sécurité au travail, de la logistique et de l'immobilier et des systèmes d'information et de communication.
Cette mutualisation des fonctions support des différentes structures a pour objectif de simplifier et moderniser les procédures et de rationaliser les moyens.